Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syngap1F6SEU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syngap1F6SEU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syngap1F6SEU4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngap1F6SEU4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms