Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prl3d2F6R3P9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prl3d2F6R3P9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl3d2F6R3P9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prl3d2F6R3P9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms