Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herc6F2Z461 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc6F2Z461 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc6F2Z461 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Herc6F2Z461 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc6F2Z461 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms