Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3020E9Q3J7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3020E9Q3J7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3020E9Q3J7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm3020E9Q3J7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3020E9Q3J7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3020E9Q3J7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3020E9Q3J7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms