Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup153E9Q3G8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup153E9Q3G8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup153E9Q3G8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup153E9Q3G8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms