Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tarbp1E9Q368 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tarbp1E9Q368 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tarbp1E9Q368 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tarbp1E9Q368 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms