Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E430018J23RikE9PZQ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E430018J23RikE9PZQ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E430018J23RikE9PZQ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms