Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E5RI56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E5RI56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E5RI56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E5RI56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E5RI56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E5RI56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E5RI56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E5RI56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E5RI56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E5RI56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E5RI56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E5RI56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E5RI56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E5RI56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E5RI56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E5RI56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E5RI56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E5RI56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E5RI56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E5RI56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E5RI56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E5RI56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E5RI56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E5RI56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E5RI56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E5RI56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E5RI56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E5RI56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E5RI56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E5RI56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E5RI56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E5RI56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E5RI56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E5RI56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E5RI56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E5RI56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E5RI56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E5RI56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E5RI56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E5RI56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E5RI56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E5RI56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E5RI56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E5RI56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E5RI56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E5RI56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E5RI56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E5RI56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E5RI56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E5RI56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E5RI56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E5RI56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E5RI56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E5RI56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E5RI56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E5RI56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E5RI56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E5RI56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E5RI56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E5RI56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E5RI56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E5RI56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E5RI56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
E5RI56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E5RI56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E5RI56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E5RI56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E5RI56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E5RI56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E5RI56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E5RI56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms