Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms