Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim12cD3Z3L3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim12cD3Z3L3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim12cD3Z3L3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim12cD3Z3L3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.2 ms