Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
3425401B19RikD3Z1D3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
3425401B19RikD3Z1D3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
3425401B19RikD3Z1D3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms