Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc6D3YZP9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc6D3YZP9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc6D3YZP9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc6D3YZP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms