Protein–RNA interactions for Protein: D3YYU8

Obsl1, Obscurin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obsl1D3YYU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Obsl1D3YYU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Obsl1D3YYU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Obsl1D3YYU8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Obsl1D3YYU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Obsl1D3YYU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obsl1D3YYU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.1 ms