Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn24D3YXJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn24D3YXJ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn24D3YXJ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn24D3YXJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms