Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm7849D3YX03 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7849D3YX03 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7849D3YX03 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7849D3YX03 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms