Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms