Protein–RNA interactions for Protein: C9J2P7

USP17L15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L15C9J2P7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L15C9J2P7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L15C9J2P7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L15C9J2P7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L15C9J2P7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L15C9J2P7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L15C9J2P7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L15C9J2P7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L15C9J2P7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms