Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CatipB9EKE5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CatipB9EKE5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CatipB9EKE5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CatipB9EKE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CatipB9EKE5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CatipB9EKE5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CatipB9EKE5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CatipB9EKE5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CatipB9EKE5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms