Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mterf1bB9EJ57 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mterf1bB9EJ57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mterf1bB9EJ57 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mterf1bB9EJ57 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms