Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
1700006A11RikB9EHI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700006A11RikB9EHI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700006A11RikB9EHI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms