Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfx1B1AY10 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nfx1B1AY10 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfx1B1AY10 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfx1B1AY10 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms