Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMTNL1A8MU46 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMTNL1A8MU46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMTNL1A8MU46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMTNL1A8MU46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms