Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3P2A8K0S8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS3P2A8K0S8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms