Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF233A6NK53 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF233A6NK53 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF233A6NK53 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF233A6NK53 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms