Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01549A6NIU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC01549A6NIU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms