Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEMA6NI47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEMA6NI47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEMA6NI47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POTEMA6NI47 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEMA6NI47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEMA6NI47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POTEMA6NI47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEMA6NI47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POTEMA6NI47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POTEMA6NI47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POTEMA6NI47 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POTEMA6NI47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
POTEMA6NI47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POTEMA6NI47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POTEMA6NI47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEMA6NI47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEMA6NI47 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEMA6NI47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POTEMA6NI47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEMA6NI47 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEMA6NI47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEMA6NI47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEMA6NI47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEMA6NI47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEMA6NI47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms