Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRABD2BA6NFA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRABD2BA6NFA1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABD2BA6NFA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms