Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L9A6NEM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L9A6NEM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L9A6NEM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms