Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6CA6NDK9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6CA6NDK9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms