Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIT2A6NDA9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms