Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L4A6NCW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L4A6NCW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP17L4A6NCW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms