Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4D1N5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4D1N5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4D1N5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4D1N5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4D1N5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4D1N5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4D1N5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A4D1N5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A4D1N5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4D1N5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4D1N5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4D1N5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4D1N5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4D1N5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A4D1N5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4D1N5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A4D1N5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4D1N5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4D1N5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4D1N5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4D1N5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4D1N5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4D1N5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4D1N5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A4D1N5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A4D1N5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4D1N5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4D1N5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4D1N5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4D1N5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4D1N5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms