Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC66A2RUB6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC66A2RUB6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC66A2RUB6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms