Protein–RNA interactions for Protein: A2BIE1

Qser1, Glutamine and serine-rich 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qser1A2BIE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Qser1A2BIE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Qser1A2BIE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Qser1A2BIE1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Qser1A2BIE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Qser1A2BIE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Qser1A2BIE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms