Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl41A2AUC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl41A2AUC9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl41A2AUC9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl41A2AUC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms