Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Upf2A2AT37 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Upf2A2AT37 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms