Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn3aA2ASI5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn3aA2ASI5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn3aA2ASI5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn3aA2ASI5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms