Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtcflA2APF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtcflA2APF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtcflA2APF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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