Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Shroom2A2ALU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Shroom2A2ALU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Shroom2A2ALU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Shroom2A2ALU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Shroom2A2ALU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Shroom2A2ALU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Shroom2A2ALU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Shroom2A2ALU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Shroom2A2ALU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Shroom2A2ALU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Shroom2A2ALU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms