Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34dA2AGU5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34dA2AGU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34dA2AGU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms