Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5938A2AEN9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm5938A2AEN9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm5938A2AEN9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm5938A2AEN9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5938A2AEN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Gm5938A2AEN9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Gm5938A2AEN9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Gm5938A2AEN9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Gm5938A2AEN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5938A2AEN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm5938A2AEN9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm5938A2AEN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm5938A2AEN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5938A2AEN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5938A2AEN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms