Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itgb4A2A863 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itgb4A2A863 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Itgb4A2A863 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Itgb4A2A863 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Itgb4A2A863 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itgb4A2A863 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms