Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdr2lA2A6T1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2lA2A6T1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2lA2A6T1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr2lA2A6T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2lA2A6T1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms