Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms