Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd3A0A140LIW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd3A0A140LIW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd3A0A140LIW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frmpd3A0A140LIW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd3A0A140LIW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd3A0A140LIW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd3A0A140LIW3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd3A0A140LIW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd3A0A140LIW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms