Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEM5

D3Ertd254e, DNA segment, Chr 3, ERATO Doi 254,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
D3Ertd254eA0A0G2JEM5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms