Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms