Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms