Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Larp1bA0A0A6YXJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms