Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28360A0A087WR25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28360A0A087WR25 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28360A0A087WR25 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28360A0A087WR25 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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